Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCKARP32238 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCKARP32238 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCKARP32238 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCKARP32238 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCKARP32238 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCKARP32238 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCKARP32238 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCKARP32238 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCKARP32238 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCKARP32238 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCKARP32238 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCKARP32238 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCKARP32238 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCKARP32238 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCKARP32238 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCKARP32238 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCKARP32238 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCKARP32238 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCKARP32238 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCKARP32238 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCKARP32238 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCKARP32238 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCKARP32238 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCKARP32238 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCKARP32238 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCKARP32238 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCKARP32238 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCKARP32238 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCKARP32238 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCKARP32238 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCKARP32238 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCKARP32238 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCKARP32238 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCKARP32238 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCKARP32238 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCKARP32238 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCKARP32238 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCKARP32238 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCKARP32238 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCKARP32238 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCKARP32238 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCKARP32238 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCKARP32238 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCKARP32238 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCKARP32238 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCKARP32238 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCKARP32238 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCKARP32238 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCKARP32238 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCKARP32238 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCKARP32238 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCKARP32238 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCKARP32238 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCKARP32238 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCKARP32238 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCKARP32238 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCKARP32238 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCKARP32238 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCKARP32238 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCKARP32238 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCKARP32238 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCKARP32238 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCKARP32238 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCKARP32238 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCKARP32238 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCKARP32238 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCKARP32238 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCKARP32238 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCKARP32238 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCKARP32238 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCKARP32238 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCKARP32238 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCKARP32238 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCKARP32238 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCKARP32238 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCKARP32238 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCKARP32238 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCKARP32238 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCKARP32238 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCKARP32238 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCKARP32238 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCKARP32238 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCKARP32238 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCKARP32238 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCKARP32238 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCKARP32238 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCKARP32238 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCKARP32238 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCKARP32238 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCKARP32238 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCKARP32238 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCKARP32238 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCKARP32238 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCKARP32238 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCKARP32238 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCKARP32238 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCKARP32238 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCKARP32238 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCKARP32238 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms