Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms