Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 211 ms