Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSMA5P28066 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMA5P28066 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms