Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms