Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
HRCP23327 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
HRCP23327 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
HRCP23327 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
HRCP23327 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
HRCP23327 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
HRCP23327 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
HRCP23327 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
HRCP23327 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
HRCP23327 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
HRCP23327 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
HRCP23327 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
HRCP23327 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
HRCP23327 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC33.5■■■□□ 2.95
HRCP23327 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
HRCP23327 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
HRCP23327 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
HRCP23327 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
HRCP23327 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
HRCP23327 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
HRCP23327 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
HRCP23327 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
HRCP23327 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
HRCP23327 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
HRCP23327 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
HRCP23327 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
HRCP23327 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
HRCP23327 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
HRCP23327 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
HRCP23327 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
HRCP23327 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
HRCP23327 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
HRCP23327 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
HRCP23327 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
HRCP23327 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
HRCP23327 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
HRCP23327 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
HRCP23327 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
HRCP23327 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
HRCP23327 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
HRCP23327 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
HRCP23327 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
HRCP23327 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
HRCP23327 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
HRCP23327 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
HRCP23327 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
HRCP23327 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
HRCP23327 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
HRCP23327 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
HRCP23327 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
HRCP23327 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
HRCP23327 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
HRCP23327 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.94
HRCP23327 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
HRCP23327 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
HRCP23327 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
HRCP23327 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
HRCP23327 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
HRCP23327 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
HRCP23327 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
HRCP23327 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
HRCP23327 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
HRCP23327 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
HRCP23327 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
HRCP23327 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
HRCP23327 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
HRCP23327 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
HRCP23327 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
HRCP23327 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
HRCP23327 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
HRCP23327 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
HRCP23327 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
HRCP23327 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
HRCP23327 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
HRCP23327 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
HRCP23327 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
HRCP23327 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
HRCP23327 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
HRCP23327 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
HRCP23327 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
HRCP23327 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
HRCP23327 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
HRCP23327 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
HRCP23327 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
HRCP23327 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
HRCP23327 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
HRCP23327 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
HRCP23327 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
HRCP23327 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
HRCP23327 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
HRCP23327 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
HRCP23327 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
HRCP23327 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
HRCP23327 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
HRCP23327 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
HRCP23327 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
HRCP23327 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
HRCP23327 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
HRCP23327 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
HRCP23327 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms