Protein–RNA interactions for Protein: P20962

PTMS, Parathymosin, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMSP20962 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTMSP20962 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTMSP20962 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTMSP20962 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTMSP20962 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTMSP20962 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTMSP20962 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTMSP20962 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTMSP20962 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTMSP20962 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTMSP20962 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTMSP20962 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTMSP20962 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTMSP20962 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTMSP20962 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTMSP20962 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTMSP20962 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTMSP20962 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTMSP20962 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTMSP20962 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTMSP20962 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTMSP20962 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTMSP20962 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTMSP20962 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTMSP20962 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTMSP20962 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTMSP20962 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTMSP20962 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTMSP20962 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTMSP20962 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTMSP20962 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTMSP20962 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTMSP20962 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTMSP20962 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTMSP20962 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTMSP20962 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTMSP20962 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTMSP20962 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTMSP20962 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTMSP20962 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTMSP20962 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTMSP20962 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTMSP20962 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PTMSP20962 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTMSP20962 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTMSP20962 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTMSP20962 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTMSP20962 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTMSP20962 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTMSP20962 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTMSP20962 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTMSP20962 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTMSP20962 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTMSP20962 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTMSP20962 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTMSP20962 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PTMSP20962 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTMSP20962 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTMSP20962 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTMSP20962 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTMSP20962 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTMSP20962 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTMSP20962 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTMSP20962 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTMSP20962 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTMSP20962 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTMSP20962 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTMSP20962 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTMSP20962 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTMSP20962 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTMSP20962 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTMSP20962 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTMSP20962 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTMSP20962 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTMSP20962 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTMSP20962 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTMSP20962 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTMSP20962 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTMSP20962 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTMSP20962 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PTMSP20962 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTMSP20962 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTMSP20962 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTMSP20962 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTMSP20962 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTMSP20962 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTMSP20962 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTMSP20962 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTMSP20962 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTMSP20962 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTMSP20962 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTMSP20962 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTMSP20962 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTMSP20962 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTMSP20962 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTMSP20962 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTMSP20962 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTMSP20962 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTMSP20962 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTMSP20962 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms