Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PVALBP20472 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PVALBP20472 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PVALBP20472 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PVALBP20472 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PVALBP20472 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PVALBP20472 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PVALBP20472 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PVALBP20472 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PVALBP20472 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PVALBP20472 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PVALBP20472 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PVALBP20472 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PVALBP20472 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PVALBP20472 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PVALBP20472 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PVALBP20472 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PVALBP20472 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PVALBP20472 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PVALBP20472 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PVALBP20472 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PVALBP20472 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PVALBP20472 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PVALBP20472 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PVALBP20472 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PVALBP20472 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PVALBP20472 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PVALBP20472 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PVALBP20472 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PVALBP20472 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PVALBP20472 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PVALBP20472 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PVALBP20472 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PVALBP20472 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PVALBP20472 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PVALBP20472 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PVALBP20472 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PVALBP20472 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PVALBP20472 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PVALBP20472 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PVALBP20472 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PVALBP20472 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PVALBP20472 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PVALBP20472 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PVALBP20472 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PVALBP20472 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PVALBP20472 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PVALBP20472 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PVALBP20472 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PVALBP20472 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PVALBP20472 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PVALBP20472 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PVALBP20472 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PVALBP20472 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PVALBP20472 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PVALBP20472 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PVALBP20472 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PVALBP20472 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PVALBP20472 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PVALBP20472 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PVALBP20472 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PVALBP20472 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PVALBP20472 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PVALBP20472 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PVALBP20472 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PVALBP20472 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PVALBP20472 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PVALBP20472 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PVALBP20472 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PVALBP20472 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PVALBP20472 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PVALBP20472 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PVALBP20472 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PVALBP20472 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PVALBP20472 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PVALBP20472 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PVALBP20472 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PVALBP20472 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PVALBP20472 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PVALBP20472 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PVALBP20472 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PVALBP20472 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PVALBP20472 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PVALBP20472 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PVALBP20472 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PVALBP20472 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PVALBP20472 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PVALBP20472 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PVALBP20472 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PVALBP20472 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PVALBP20472 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PVALBP20472 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PVALBP20472 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PVALBP20472 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PVALBP20472 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PVALBP20472 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PVALBP20472 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PVALBP20472 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PVALBP20472 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PVALBP20472 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms