Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms