Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCP1P17987 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCP1P17987 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCP1P17987 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCP1P17987 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCP1P17987 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCP1P17987 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCP1P17987 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCP1P17987 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCP1P17987 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCP1P17987 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCP1P17987 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCP1P17987 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCP1P17987 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCP1P17987 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCP1P17987 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCP1P17987 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TCP1P17987 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TCP1P17987 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCP1P17987 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCP1P17987 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCP1P17987 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCP1P17987 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCP1P17987 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCP1P17987 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCP1P17987 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCP1P17987 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCP1P17987 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCP1P17987 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCP1P17987 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCP1P17987 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCP1P17987 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCP1P17987 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCP1P17987 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCP1P17987 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCP1P17987 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TCP1P17987 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCP1P17987 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCP1P17987 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCP1P17987 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCP1P17987 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCP1P17987 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCP1P17987 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCP1P17987 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCP1P17987 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCP1P17987 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCP1P17987 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCP1P17987 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCP1P17987 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCP1P17987 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCP1P17987 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCP1P17987 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCP1P17987 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCP1P17987 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCP1P17987 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCP1P17987 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCP1P17987 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCP1P17987 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCP1P17987 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCP1P17987 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCP1P17987 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCP1P17987 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCP1P17987 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCP1P17987 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TCP1P17987 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCP1P17987 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TCP1P17987 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCP1P17987 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCP1P17987 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCP1P17987 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TCP1P17987 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCP1P17987 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCP1P17987 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCP1P17987 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCP1P17987 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCP1P17987 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCP1P17987 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCP1P17987 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCP1P17987 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCP1P17987 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCP1P17987 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCP1P17987 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TCP1P17987 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCP1P17987 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCP1P17987 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCP1P17987 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCP1P17987 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCP1P17987 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TCP1P17987 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCP1P17987 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCP1P17987 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCP1P17987 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TCP1P17987 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCP1P17987 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCP1P17987 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCP1P17987 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCP1P17987 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCP1P17987 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCP1P17987 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCP1P17987 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms