Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
XBP1P17861 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
XBP1P17861 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XBP1P17861 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
XBP1P17861 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
XBP1P17861 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XBP1P17861 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XBP1P17861 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
XBP1P17861 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XBP1P17861 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
XBP1P17861 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
XBP1P17861 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
XBP1P17861 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XBP1P17861 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XBP1P17861 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
XBP1P17861 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
XBP1P17861 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
XBP1P17861 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
XBP1P17861 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
XBP1P17861 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XBP1P17861 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
XBP1P17861 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
XBP1P17861 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
XBP1P17861 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
XBP1P17861 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XBP1P17861 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XBP1P17861 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XBP1P17861 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XBP1P17861 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XBP1P17861 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
XBP1P17861 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
XBP1P17861 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
XBP1P17861 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XBP1P17861 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XBP1P17861 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
XBP1P17861 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
XBP1P17861 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
XBP1P17861 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XBP1P17861 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
XBP1P17861 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XBP1P17861 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
XBP1P17861 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
XBP1P17861 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
XBP1P17861 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
XBP1P17861 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
XBP1P17861 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
XBP1P17861 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
XBP1P17861 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
XBP1P17861 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
XBP1P17861 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XBP1P17861 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XBP1P17861 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XBP1P17861 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XBP1P17861 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XBP1P17861 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XBP1P17861 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
XBP1P17861 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XBP1P17861 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XBP1P17861 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XBP1P17861 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XBP1P17861 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XBP1P17861 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XBP1P17861 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XBP1P17861 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XBP1P17861 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XBP1P17861 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
XBP1P17861 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XBP1P17861 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XBP1P17861 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XBP1P17861 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XBP1P17861 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XBP1P17861 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XBP1P17861 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XBP1P17861 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XBP1P17861 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XBP1P17861 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XBP1P17861 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XBP1P17861 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XBP1P17861 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XBP1P17861 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XBP1P17861 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XBP1P17861 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XBP1P17861 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XBP1P17861 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XBP1P17861 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XBP1P17861 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XBP1P17861 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XBP1P17861 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XBP1P17861 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XBP1P17861 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XBP1P17861 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XBP1P17861 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XBP1P17861 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XBP1P17861 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XBP1P17861 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
XBP1P17861 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
XBP1P17861 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
XBP1P17861 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XBP1P17861 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XBP1P17861 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms