Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXB9P17482 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms