Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOT1P17174 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOT1P17174 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOT1P17174 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOT1P17174 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOT1P17174 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOT1P17174 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOT1P17174 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOT1P17174 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOT1P17174 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOT1P17174 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOT1P17174 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOT1P17174 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOT1P17174 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOT1P17174 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOT1P17174 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOT1P17174 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOT1P17174 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOT1P17174 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOT1P17174 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOT1P17174 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOT1P17174 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOT1P17174 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOT1P17174 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOT1P17174 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOT1P17174 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOT1P17174 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOT1P17174 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOT1P17174 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOT1P17174 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOT1P17174 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOT1P17174 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOT1P17174 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOT1P17174 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GOT1P17174 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOT1P17174 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOT1P17174 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOT1P17174 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOT1P17174 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOT1P17174 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOT1P17174 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOT1P17174 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOT1P17174 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOT1P17174 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GOT1P17174 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOT1P17174 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOT1P17174 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOT1P17174 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOT1P17174 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOT1P17174 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOT1P17174 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOT1P17174 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOT1P17174 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOT1P17174 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOT1P17174 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOT1P17174 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOT1P17174 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOT1P17174 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOT1P17174 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOT1P17174 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOT1P17174 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOT1P17174 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOT1P17174 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOT1P17174 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOT1P17174 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOT1P17174 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOT1P17174 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOT1P17174 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GOT1P17174 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GOT1P17174 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GOT1P17174 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GOT1P17174 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOT1P17174 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOT1P17174 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GOT1P17174 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOT1P17174 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOT1P17174 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOT1P17174 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOT1P17174 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOT1P17174 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOT1P17174 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOT1P17174 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOT1P17174 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOT1P17174 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOT1P17174 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOT1P17174 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOT1P17174 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOT1P17174 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GOT1P17174 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOT1P17174 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOT1P17174 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOT1P17174 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOT1P17174 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOT1P17174 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOT1P17174 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOT1P17174 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOT1P17174 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOT1P17174 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOT1P17174 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOT1P17174 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms