Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD44P16070 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD44P16070 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CD44P16070 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD44P16070 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD44P16070 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD44P16070 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CD44P16070 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD44P16070 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD44P16070 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD44P16070 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD44P16070 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CD44P16070 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD44P16070 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD44P16070 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD44P16070 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD44P16070 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD44P16070 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD44P16070 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD44P16070 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD44P16070 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD44P16070 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD44P16070 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD44P16070 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD44P16070 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD44P16070 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD44P16070 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CD44P16070 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD44P16070 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD44P16070 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD44P16070 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD44P16070 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD44P16070 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD44P16070 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD44P16070 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD44P16070 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD44P16070 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD44P16070 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD44P16070 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD44P16070 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD44P16070 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD44P16070 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD44P16070 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD44P16070 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD44P16070 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD44P16070 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD44P16070 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD44P16070 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD44P16070 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD44P16070 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CD44P16070 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CD44P16070 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD44P16070 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD44P16070 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD44P16070 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD44P16070 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD44P16070 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD44P16070 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD44P16070 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD44P16070 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD44P16070 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD44P16070 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD44P16070 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD44P16070 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD44P16070 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD44P16070 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD44P16070 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD44P16070 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD44P16070 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD44P16070 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD44P16070 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD44P16070 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD44P16070 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD44P16070 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD44P16070 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD44P16070 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD44P16070 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD44P16070 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD44P16070 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD44P16070 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD44P16070 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD44P16070 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD44P16070 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD44P16070 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD44P16070 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CD44P16070 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD44P16070 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD44P16070 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD44P16070 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD44P16070 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD44P16070 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD44P16070 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD44P16070 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD44P16070 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD44P16070 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CD44P16070 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD44P16070 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD44P16070 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD44P16070 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD44P16070 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms