Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms