Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPA1P15085 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPA1P15085 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPA1P15085 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPA1P15085 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPA1P15085 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPA1P15085 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPA1P15085 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPA1P15085 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPA1P15085 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPA1P15085 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CPA1P15085 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPA1P15085 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPA1P15085 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPA1P15085 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPA1P15085 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPA1P15085 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPA1P15085 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPA1P15085 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPA1P15085 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPA1P15085 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPA1P15085 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPA1P15085 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPA1P15085 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPA1P15085 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPA1P15085 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPA1P15085 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPA1P15085 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CPA1P15085 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CPA1P15085 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CPA1P15085 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CPA1P15085 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CPA1P15085 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CPA1P15085 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CPA1P15085 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CPA1P15085 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPA1P15085 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPA1P15085 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPA1P15085 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPA1P15085 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPA1P15085 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPA1P15085 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPA1P15085 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPA1P15085 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPA1P15085 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPA1P15085 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPA1P15085 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPA1P15085 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPA1P15085 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CPA1P15085 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPA1P15085 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPA1P15085 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPA1P15085 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPA1P15085 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPA1P15085 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPA1P15085 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPA1P15085 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPA1P15085 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPA1P15085 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPA1P15085 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPA1P15085 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPA1P15085 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPA1P15085 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPA1P15085 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPA1P15085 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPA1P15085 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPA1P15085 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPA1P15085 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPA1P15085 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CPA1P15085 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPA1P15085 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPA1P15085 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPA1P15085 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPA1P15085 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPA1P15085 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPA1P15085 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPA1P15085 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CPA1P15085 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPA1P15085 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPA1P15085 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPA1P15085 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPA1P15085 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPA1P15085 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPA1P15085 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPA1P15085 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPA1P15085 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPA1P15085 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPA1P15085 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPA1P15085 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPA1P15085 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPA1P15085 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPA1P15085 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPA1P15085 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPA1P15085 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CPA1P15085 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPA1P15085 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CPA1P15085 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPA1P15085 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CPA1P15085 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPA1P15085 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms