Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms