Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCG2P13521 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCG2P13521 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCG2P13521 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCG2P13521 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCG2P13521 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCG2P13521 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCG2P13521 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCG2P13521 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCG2P13521 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCG2P13521 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCG2P13521 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCG2P13521 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCG2P13521 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SCG2P13521 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCG2P13521 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCG2P13521 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCG2P13521 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCG2P13521 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SCG2P13521 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCG2P13521 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCG2P13521 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCG2P13521 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCG2P13521 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCG2P13521 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCG2P13521 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCG2P13521 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCG2P13521 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCG2P13521 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCG2P13521 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCG2P13521 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCG2P13521 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCG2P13521 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCG2P13521 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCG2P13521 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SCG2P13521 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCG2P13521 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCG2P13521 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SCG2P13521 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCG2P13521 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCG2P13521 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCG2P13521 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCG2P13521 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCG2P13521 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCG2P13521 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCG2P13521 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SCG2P13521 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCG2P13521 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCG2P13521 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCG2P13521 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCG2P13521 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCG2P13521 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SCG2P13521 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCG2P13521 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCG2P13521 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCG2P13521 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCG2P13521 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCG2P13521 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCG2P13521 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCG2P13521 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCG2P13521 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCG2P13521 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCG2P13521 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCG2P13521 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCG2P13521 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCG2P13521 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCG2P13521 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCG2P13521 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCG2P13521 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCG2P13521 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCG2P13521 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCG2P13521 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCG2P13521 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCG2P13521 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCG2P13521 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCG2P13521 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCG2P13521 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCG2P13521 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCG2P13521 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCG2P13521 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCG2P13521 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCG2P13521 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCG2P13521 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCG2P13521 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCG2P13521 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCG2P13521 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCG2P13521 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCG2P13521 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCG2P13521 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCG2P13521 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCG2P13521 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCG2P13521 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCG2P13521 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCG2P13521 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCG2P13521 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCG2P13521 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCG2P13521 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCG2P13521 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCG2P13521 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCG2P13521 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms