Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ESRRAP11474 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ESRRAP11474 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ESRRAP11474 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ESRRAP11474 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ESRRAP11474 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ESRRAP11474 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ESRRAP11474 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ESRRAP11474 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ESRRAP11474 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ESRRAP11474 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ESRRAP11474 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ESRRAP11474 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ESRRAP11474 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ESRRAP11474 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ESRRAP11474 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ESRRAP11474 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ESRRAP11474 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ESRRAP11474 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ESRRAP11474 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ESRRAP11474 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ESRRAP11474 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ESRRAP11474 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ESRRAP11474 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ESRRAP11474 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ESRRAP11474 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ESRRAP11474 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ESRRAP11474 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ESRRAP11474 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ESRRAP11474 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ESRRAP11474 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ESRRAP11474 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ESRRAP11474 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ESRRAP11474 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ESRRAP11474 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ESRRAP11474 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ESRRAP11474 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ESRRAP11474 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ESRRAP11474 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ESRRAP11474 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ESRRAP11474 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ESRRAP11474 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ESRRAP11474 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ESRRAP11474 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ESRRAP11474 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ESRRAP11474 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ESRRAP11474 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ESRRAP11474 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ESRRAP11474 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ESRRAP11474 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ESRRAP11474 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ESRRAP11474 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ESRRAP11474 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ESRRAP11474 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ESRRAP11474 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ESRRAP11474 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ESRRAP11474 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ESRRAP11474 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ESRRAP11474 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ESRRAP11474 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ESRRAP11474 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ESRRAP11474 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ESRRAP11474 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ESRRAP11474 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ESRRAP11474 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ESRRAP11474 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ESRRAP11474 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ESRRAP11474 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ESRRAP11474 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ESRRAP11474 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ESRRAP11474 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ESRRAP11474 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ESRRAP11474 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ESRRAP11474 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ESRRAP11474 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ESRRAP11474 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ESRRAP11474 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ESRRAP11474 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ESRRAP11474 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ESRRAP11474 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ESRRAP11474 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ESRRAP11474 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ESRRAP11474 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ESRRAP11474 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms