Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC38.38■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC38.38■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC38.38■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC38.36■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
TOP2AP11388 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC38.28■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms