Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms