Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRFP10586 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms