Protein–RNA interactions for Protein: P10144

GZMB, Granzyme B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMBP10144 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GZMBP10144 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GZMBP10144 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GZMBP10144 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GZMBP10144 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GZMBP10144 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GZMBP10144 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GZMBP10144 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GZMBP10144 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GZMBP10144 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GZMBP10144 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GZMBP10144 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GZMBP10144 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GZMBP10144 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GZMBP10144 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GZMBP10144 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GZMBP10144 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GZMBP10144 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GZMBP10144 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GZMBP10144 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GZMBP10144 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GZMBP10144 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GZMBP10144 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GZMBP10144 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GZMBP10144 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GZMBP10144 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GZMBP10144 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GZMBP10144 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GZMBP10144 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GZMBP10144 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GZMBP10144 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GZMBP10144 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GZMBP10144 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GZMBP10144 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GZMBP10144 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GZMBP10144 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GZMBP10144 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GZMBP10144 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GZMBP10144 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GZMBP10144 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GZMBP10144 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GZMBP10144 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GZMBP10144 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GZMBP10144 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GZMBP10144 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GZMBP10144 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GZMBP10144 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GZMBP10144 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GZMBP10144 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GZMBP10144 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GZMBP10144 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GZMBP10144 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GZMBP10144 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GZMBP10144 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GZMBP10144 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GZMBP10144 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GZMBP10144 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GZMBP10144 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GZMBP10144 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GZMBP10144 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GZMBP10144 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GZMBP10144 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GZMBP10144 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GZMBP10144 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GZMBP10144 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GZMBP10144 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GZMBP10144 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GZMBP10144 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GZMBP10144 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GZMBP10144 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GZMBP10144 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GZMBP10144 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GZMBP10144 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GZMBP10144 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GZMBP10144 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GZMBP10144 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GZMBP10144 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GZMBP10144 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GZMBP10144 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GZMBP10144 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GZMBP10144 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GZMBP10144 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GZMBP10144 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GZMBP10144 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GZMBP10144 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GZMBP10144 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GZMBP10144 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GZMBP10144 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GZMBP10144 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GZMBP10144 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GZMBP10144 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GZMBP10144 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GZMBP10144 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GZMBP10144 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GZMBP10144 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GZMBP10144 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GZMBP10144 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GZMBP10144 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GZMBP10144 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GZMBP10144 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms