Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GLI4P10075 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GLI4P10075 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GLI4P10075 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GLI4P10075 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GLI4P10075 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GLI4P10075 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GLI4P10075 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GLI4P10075 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GLI4P10075 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GLI4P10075 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GLI4P10075 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GLI4P10075 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GLI4P10075 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GLI4P10075 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GLI4P10075 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GLI4P10075 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GLI4P10075 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GLI4P10075 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GLI4P10075 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GLI4P10075 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GLI4P10075 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GLI4P10075 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GLI4P10075 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GLI4P10075 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GLI4P10075 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GLI4P10075 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GLI4P10075 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GLI4P10075 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GLI4P10075 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GLI4P10075 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GLI4P10075 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GLI4P10075 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GLI4P10075 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GLI4P10075 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GLI4P10075 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GLI4P10075 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GLI4P10075 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GLI4P10075 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GLI4P10075 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GLI4P10075 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GLI4P10075 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GLI4P10075 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GLI4P10075 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GLI4P10075 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GLI4P10075 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GLI4P10075 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GLI4P10075 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GLI4P10075 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GLI4P10075 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GLI4P10075 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GLI4P10075 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GLI4P10075 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GLI4P10075 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GLI4P10075 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GLI4P10075 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GLI4P10075 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GLI4P10075 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GLI4P10075 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GLI4P10075 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GLI4P10075 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GLI4P10075 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GLI4P10075 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GLI4P10075 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GLI4P10075 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GLI4P10075 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GLI4P10075 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GLI4P10075 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GLI4P10075 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GLI4P10075 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GLI4P10075 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GLI4P10075 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GLI4P10075 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GLI4P10075 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GLI4P10075 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GLI4P10075 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
GLI4P10075 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GLI4P10075 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GLI4P10075 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GLI4P10075 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GLI4P10075 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GLI4P10075 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GLI4P10075 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GLI4P10075 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GLI4P10075 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GLI4P10075 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GLI4P10075 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GLI4P10075 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GLI4P10075 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GLI4P10075 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GLI4P10075 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GLI4P10075 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GLI4P10075 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GLI4P10075 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GLI4P10075 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GLI4P10075 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GLI4P10075 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GLI4P10075 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GLI4P10075 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GLI4P10075 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms