Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms