Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NGFRP08138 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NGFRP08138 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NGFRP08138 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NGFRP08138 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NGFRP08138 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NGFRP08138 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NGFRP08138 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NGFRP08138 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NGFRP08138 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NGFRP08138 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NGFRP08138 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NGFRP08138 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NGFRP08138 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NGFRP08138 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NGFRP08138 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NGFRP08138 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NGFRP08138 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NGFRP08138 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NGFRP08138 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NGFRP08138 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NGFRP08138 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NGFRP08138 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NGFRP08138 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NGFRP08138 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NGFRP08138 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NGFRP08138 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NGFRP08138 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NGFRP08138 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NGFRP08138 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NGFRP08138 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NGFRP08138 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NGFRP08138 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NGFRP08138 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NGFRP08138 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NGFRP08138 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NGFRP08138 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NGFRP08138 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NGFRP08138 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NGFRP08138 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NGFRP08138 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NGFRP08138 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NGFRP08138 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NGFRP08138 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NGFRP08138 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NGFRP08138 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NGFRP08138 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NGFRP08138 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NGFRP08138 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NGFRP08138 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NGFRP08138 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NGFRP08138 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NGFRP08138 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NGFRP08138 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NGFRP08138 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NGFRP08138 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NGFRP08138 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NGFRP08138 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NGFRP08138 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NGFRP08138 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NGFRP08138 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NGFRP08138 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NGFRP08138 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NGFRP08138 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NGFRP08138 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NGFRP08138 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NGFRP08138 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NGFRP08138 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NGFRP08138 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NGFRP08138 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NGFRP08138 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NGFRP08138 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NGFRP08138 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NGFRP08138 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NGFRP08138 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NGFRP08138 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NGFRP08138 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NGFRP08138 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NGFRP08138 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NGFRP08138 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NGFRP08138 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NGFRP08138 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NGFRP08138 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NGFRP08138 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NGFRP08138 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NGFRP08138 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NGFRP08138 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NGFRP08138 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NGFRP08138 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NGFRP08138 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NGFRP08138 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NGFRP08138 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NGFRP08138 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NGFRP08138 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NGFRP08138 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NGFRP08138 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NGFRP08138 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NGFRP08138 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NGFRP08138 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NGFRP08138 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms