Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPM2P07951 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPM2P07951 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPM2P07951 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPM2P07951 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPM2P07951 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPM2P07951 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPM2P07951 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPM2P07951 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TPM2P07951 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPM2P07951 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPM2P07951 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPM2P07951 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPM2P07951 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPM2P07951 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPM2P07951 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPM2P07951 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPM2P07951 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPM2P07951 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPM2P07951 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPM2P07951 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPM2P07951 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPM2P07951 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPM2P07951 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPM2P07951 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPM2P07951 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPM2P07951 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPM2P07951 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPM2P07951 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPM2P07951 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPM2P07951 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPM2P07951 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPM2P07951 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPM2P07951 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPM2P07951 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPM2P07951 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPM2P07951 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPM2P07951 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPM2P07951 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPM2P07951 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TPM2P07951 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPM2P07951 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPM2P07951 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPM2P07951 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPM2P07951 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPM2P07951 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPM2P07951 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPM2P07951 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPM2P07951 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPM2P07951 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPM2P07951 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPM2P07951 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPM2P07951 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPM2P07951 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPM2P07951 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM2P07951 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM2P07951 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM2P07951 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM2P07951 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM2P07951 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM2P07951 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM2P07951 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM2P07951 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM2P07951 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM2P07951 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM2P07951 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM2P07951 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM2P07951 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM2P07951 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM2P07951 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM2P07951 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPM2P07951 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPM2P07951 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPM2P07951 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPM2P07951 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPM2P07951 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPM2P07951 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPM2P07951 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPM2P07951 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPM2P07951 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPM2P07951 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPM2P07951 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM2P07951 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM2P07951 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM2P07951 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM2P07951 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM2P07951 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM2P07951 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM2P07951 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM2P07951 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM2P07951 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM2P07951 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM2P07951 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM2P07951 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM2P07951 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPM2P07951 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPM2P07951 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPM2P07951 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TPM2P07951 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPM2P07951 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms