Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTMAP06454 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTMAP06454 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTMAP06454 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTMAP06454 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTMAP06454 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTMAP06454 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTMAP06454 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTMAP06454 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTMAP06454 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTMAP06454 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTMAP06454 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTMAP06454 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTMAP06454 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTMAP06454 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTMAP06454 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTMAP06454 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTMAP06454 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTMAP06454 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTMAP06454 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTMAP06454 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTMAP06454 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTMAP06454 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTMAP06454 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PTMAP06454 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTMAP06454 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTMAP06454 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PTMAP06454 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTMAP06454 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTMAP06454 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTMAP06454 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTMAP06454 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTMAP06454 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTMAP06454 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTMAP06454 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTMAP06454 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTMAP06454 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTMAP06454 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTMAP06454 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTMAP06454 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTMAP06454 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTMAP06454 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTMAP06454 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTMAP06454 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTMAP06454 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTMAP06454 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTMAP06454 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTMAP06454 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTMAP06454 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTMAP06454 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTMAP06454 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTMAP06454 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTMAP06454 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTMAP06454 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTMAP06454 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTMAP06454 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTMAP06454 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTMAP06454 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTMAP06454 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTMAP06454 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTMAP06454 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTMAP06454 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTMAP06454 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTMAP06454 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTMAP06454 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTMAP06454 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTMAP06454 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTMAP06454 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTMAP06454 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTMAP06454 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTMAP06454 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTMAP06454 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTMAP06454 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTMAP06454 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTMAP06454 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTMAP06454 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTMAP06454 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTMAP06454 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTMAP06454 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTMAP06454 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTMAP06454 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTMAP06454 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTMAP06454 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTMAP06454 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTMAP06454 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTMAP06454 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTMAP06454 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTMAP06454 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTMAP06454 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTMAP06454 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTMAP06454 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTMAP06454 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTMAP06454 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTMAP06454 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTMAP06454 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTMAP06454 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTMAP06454 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTMAP06454 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTMAP06454 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTMAP06454 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms