Protein–RNA interactions for Protein: O95475

SIX6, Homeobox protein SIX6, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX6O95475 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIX6O95475 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIX6O95475 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX6O95475 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX6O95475 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX6O95475 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX6O95475 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX6O95475 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX6O95475 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX6O95475 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX6O95475 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX6O95475 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX6O95475 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX6O95475 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX6O95475 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX6O95475 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX6O95475 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX6O95475 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX6O95475 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX6O95475 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX6O95475 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX6O95475 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX6O95475 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX6O95475 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX6O95475 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX6O95475 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX6O95475 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX6O95475 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX6O95475 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX6O95475 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX6O95475 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX6O95475 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX6O95475 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX6O95475 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX6O95475 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX6O95475 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX6O95475 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX6O95475 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX6O95475 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX6O95475 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX6O95475 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX6O95475 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX6O95475 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX6O95475 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX6O95475 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX6O95475 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX6O95475 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX6O95475 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX6O95475 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX6O95475 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX6O95475 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX6O95475 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX6O95475 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX6O95475 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX6O95475 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX6O95475 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIX6O95475 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIX6O95475 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIX6O95475 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIX6O95475 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIX6O95475 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIX6O95475 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIX6O95475 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SIX6O95475 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIX6O95475 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIX6O95475 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIX6O95475 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIX6O95475 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIX6O95475 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX6O95475 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX6O95475 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX6O95475 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX6O95475 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX6O95475 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX6O95475 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX6O95475 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX6O95475 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX6O95475 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX6O95475 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX6O95475 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX6O95475 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX6O95475 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX6O95475 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX6O95475 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX6O95475 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX6O95475 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIX6O95475 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIX6O95475 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIX6O95475 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SIX6O95475 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIX6O95475 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIX6O95475 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIX6O95475 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SIX6O95475 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SIX6O95475 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIX6O95475 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIX6O95475 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIX6O95475 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIX6O95475 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SIX6O95475 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms