Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIF4AO95239 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms