Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCTN3O75935 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms