Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC22O60826 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC22O60826 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms