Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCXO43602 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCXO43602 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCXO43602 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCXO43602 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DCXO43602 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCXO43602 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DCXO43602 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCXO43602 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCXO43602 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCXO43602 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCXO43602 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCXO43602 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCXO43602 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCXO43602 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCXO43602 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCXO43602 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCXO43602 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCXO43602 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCXO43602 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCXO43602 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCXO43602 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCXO43602 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCXO43602 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCXO43602 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCXO43602 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCXO43602 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCXO43602 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCXO43602 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCXO43602 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCXO43602 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCXO43602 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCXO43602 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCXO43602 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCXO43602 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCXO43602 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCXO43602 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCXO43602 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCXO43602 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCXO43602 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCXO43602 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DCXO43602 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCXO43602 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCXO43602 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCXO43602 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCXO43602 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCXO43602 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCXO43602 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DCXO43602 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCXO43602 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCXO43602 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCXO43602 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCXO43602 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCXO43602 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCXO43602 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DCXO43602 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCXO43602 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCXO43602 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCXO43602 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCXO43602 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCXO43602 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCXO43602 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCXO43602 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCXO43602 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCXO43602 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCXO43602 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCXO43602 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCXO43602 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCXO43602 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCXO43602 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCXO43602 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCXO43602 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCXO43602 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCXO43602 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DCXO43602 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCXO43602 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCXO43602 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCXO43602 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCXO43602 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCXO43602 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCXO43602 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCXO43602 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCXO43602 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCXO43602 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCXO43602 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DCXO43602 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DCXO43602 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DCXO43602 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCXO43602 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DCXO43602 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DCXO43602 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCXO43602 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCXO43602 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCXO43602 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCXO43602 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCXO43602 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCXO43602 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCXO43602 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCXO43602 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCXO43602 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms