Protein–RNA interactions for Protein: O43586

PSTPIP1, Proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSTPIP1O43586 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSTPIP1O43586 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms