Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA2O43364 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms