Protein–RNA interactions for Protein: O43252

PAPSS1, Bifunctional 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPSS1O43252 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAPSS1O43252 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms