Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP290O15078 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP290O15078 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP290O15078 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP290O15078 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CEP290O15078 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CEP290O15078 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CEP290O15078 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CEP290O15078 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CEP290O15078 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CEP290O15078 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CEP290O15078 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CEP290O15078 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CEP290O15078 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CEP290O15078 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CEP290O15078 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CEP290O15078 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CEP290O15078 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CEP290O15078 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CEP290O15078 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CEP290O15078 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CEP290O15078 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CEP290O15078 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CEP290O15078 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CEP290O15078 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CEP290O15078 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CEP290O15078 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CEP290O15078 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CEP290O15078 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CEP290O15078 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CEP290O15078 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CEP290O15078 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CEP290O15078 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CEP290O15078 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CEP290O15078 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CEP290O15078 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CEP290O15078 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CEP290O15078 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CEP290O15078 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CEP290O15078 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CEP290O15078 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CEP290O15078 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CEP290O15078 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CEP290O15078 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CEP290O15078 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CEP290O15078 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CEP290O15078 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CEP290O15078 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CEP290O15078 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CEP290O15078 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CEP290O15078 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CEP290O15078 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CEP290O15078 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CEP290O15078 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CEP290O15078 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CEP290O15078 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CEP290O15078 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CEP290O15078 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP290O15078 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP290O15078 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP290O15078 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP290O15078 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP290O15078 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP290O15078 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP290O15078 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP290O15078 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP290O15078 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP290O15078 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP290O15078 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP290O15078 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP290O15078 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEP290O15078 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEP290O15078 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEP290O15078 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEP290O15078 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEP290O15078 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEP290O15078 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEP290O15078 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEP290O15078 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEP290O15078 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CEP290O15078 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEP290O15078 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEP290O15078 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP290O15078 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP290O15078 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP290O15078 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP290O15078 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP290O15078 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP290O15078 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP290O15078 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP290O15078 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP290O15078 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP290O15078 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP290O15078 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP290O15078 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP290O15078 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP290O15078 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP290O15078 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP290O15078 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP290O15078 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
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