Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLRMTO00411 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms