Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ARVCFO00192 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms