Protein–RNA interactions for Protein: H3BU77

CCDC179, Coiled-coil domain-containing protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC179H3BU77 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCDC179H3BU77 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms