Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms