Protein–RNA interactions for Protein: B3SHH9

TMEM114, Transmembrane protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM114B3SHH9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM114B3SHH9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM114B3SHH9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM114B3SHH9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM114B3SHH9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM114B3SHH9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM114B3SHH9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM114B3SHH9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM114B3SHH9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM114B3SHH9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM114B3SHH9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM114B3SHH9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM114B3SHH9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM114B3SHH9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM114B3SHH9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM114B3SHH9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM114B3SHH9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM114B3SHH9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM114B3SHH9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM114B3SHH9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM114B3SHH9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM114B3SHH9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM114B3SHH9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM114B3SHH9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM114B3SHH9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM114B3SHH9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM114B3SHH9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM114B3SHH9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM114B3SHH9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM114B3SHH9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM114B3SHH9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM114B3SHH9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM114B3SHH9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM114B3SHH9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM114B3SHH9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM114B3SHH9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms