Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms