Protein–RNA interactions for Protein: A6NLE4

SMIM23, Small integral membrane protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM23A6NLE4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMIM23A6NLE4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMIM23A6NLE4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM23A6NLE4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM23A6NLE4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM23A6NLE4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM23A6NLE4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM23A6NLE4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM23A6NLE4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM23A6NLE4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM23A6NLE4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM23A6NLE4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM23A6NLE4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM23A6NLE4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM23A6NLE4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM23A6NLE4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM23A6NLE4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM23A6NLE4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM23A6NLE4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM23A6NLE4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM23A6NLE4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM23A6NLE4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM23A6NLE4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM23A6NLE4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM23A6NLE4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM23A6NLE4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM23A6NLE4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMIM23A6NLE4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM23A6NLE4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM23A6NLE4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM23A6NLE4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM23A6NLE4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM23A6NLE4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM23A6NLE4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM23A6NLE4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM23A6NLE4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM23A6NLE4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM23A6NLE4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms