Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms