Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms