Protein–RNA interactions for Protein: A5PL33

KRBA1, Protein KRBA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA1A5PL33 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KRBA1A5PL33 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms