Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTAGE9A4FU28 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms