Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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