Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms